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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 2010 | Merlin: metabolic models reconstruction using genome-scale information | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Dez-2021 | Metabolic engineering of Escherichia coli for biotechnological chondroitin production | Couto, Márcia R.; Dias, Oscar; Rodrigues, Joana Lúcia Lima Correia, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 17-Mai-2015 | Metabolic models reconstruction using genome scale information (merlin): assessment and validation | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 3-Nov-2009 | Metabolic reconstruction of less characterized microorganisms : a new methodology for reaction identification from genome sequencing data | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 18-Out-2023 | Metabolic reconstruction of the human pathogen Candida auris: using a cross-species approach for drug target prediction | Viana, Romeu; Carreiro, Tiago; Couceiro, Diogo, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2014 | Metagenomic analysis of the saliva microbiome with merlin | Barbosa, Pedro; Dias, Oscar; Arrais, Joel P., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Nov-2023 | Microalgae biomass as an alternative source of biocompounds: New insights and future perspectives of extraction methodologies | Sousa, Vítor; Pereira, Ricardo Nuno Correia; Vicente, A. A., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 23-Mar-2022 | Modelling aptamers with nucleic acid mimics (NAM): from sequence to three-dimensional docking | Oliveira, Ricardo; Pinho, Eva; Sousa, Ana Luísa, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 6-Jul-2017 | Modelling interspecies interactions of syntrophic communities | Oliveira, Emanuel; Ferreira, Eugénio C.; Dias, Oscar | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 30-Nov-2007 | Monitoring activated sludge systems from wastewater treatment plants : automated image analysis procedures and their relation with operating parameters | Mesquita, D. P.; Dias, Oscar; Amaral, A. L., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Abr-2009 | Monitoring of activated sludge settling ability through image analysis: validation on full-scale wastewater treatment plants | Mesquita, D. P.; Dias, Oscar; Amaral, A. L., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 14-Mar-2024 | Optimization of chondroitin production in E. coli using genome scale models | Couto, Márcia R.; Rodrigues, Joana Lúcia Lima Correia; Braga, Adelaide Correia, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Dez-2021 | OrtSuite: from genomes to prediction of microbial interactions within targeted ecosystem processes | Saraiva, João Pedro; Bartholomäus, Alexandre; Kallies, René, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2020 | Predicting promoters in phage genomes using machine learning models | Sampaio, Marta; Rocha, Miguel; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 15-Dez-2019 | Predicting promoters in phage genomes using PhagePromoter | Sampaio, Marta; Rocha, Miguel; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes, et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2014 | Prediction of protein subunits using KEGG BRITE | Dias, Oscar; Liu, Filipe; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Fev-2018 | Quantitative physiology and elemental composition of Kluyveromyces lactis CBS 2359 during growth on glucose at different specific growth rates | Dias, Oscar; Basso, Thiago O.; Rocha, I., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2020 | A reconciled version of the cork oak tree genome-scale metabolic model | Silva, Miguel Ângelo Fernandes da; Lima, Diogo Batista; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Reconciliation of regulatory data: the regulatory networks of Escherichia coli and Bacillus subtilis | Lima, Diogo; Cruz, Fernando; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 2010 | Reconstructing genome-scale metabolic models with Merlin | Dias, Oscar; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
