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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| Mar-2019 | Mapping Salmonella typhimurium pathways using ¹³C metabolic flux analysis | Correia, Daniela M.; Sargo, C.; Silva, A., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 1998 | Mass transfer properties of glucose and O2 in Saccharomyces cerevisiae flocs | Vicente, A. A.; Dluhý, M.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2007 | A mathematical model for a Salmonella bacteriophage | Santos, Sílvio Roberto Branco; Azeredo, Joana; Nicolau, Ana, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Set-2008 | Mathematical modeling of recombinant Escherichia coli aerobic batch fermentations | Costa, Rafael S.; Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 5-Out-2000 | Measurement of acetate during the production of recombinant proteins with E. coli | Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 8-Jun-2015 | Merlin latest developments for pathways analysis | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 25-Fev-2021 | merlin v4. 0: an updated platform for the reconstruction of high-quality genome-scale metabolic models | Capela, João; Lagoa, D.; Rodrigues, Rúben, et al. | Preprint | Acesso aberto |
| 2020 | merlin v4: an updated platform for reconstructing genome-scale metabolic models | Lima, Diogo Batista; Lagoa, Davide Rafael Santos; Cruz, Fernando João Pereira da, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 24-Jun-2022 | merlin, an improved framework for the reconstruction of high-quality genome-scale metabolic models | Capela, João; Lagoa, Davide Rafael Santos; Rodrigues, Rúben André Costa, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2010 | Merlin: metabolic models reconstruction using genome-scale information | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Metabolic footprint analysis of recombinant Escherichia coli strains during fed-batch fermentations | Carneiro, S.; Villas-Bôas, S. G.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Set-2009 | Metabolic footprinting of Escherichia coli grown in fed-batch fermentation during recombinant protein production | Carneiro, S.; Villas-Bôas, S. G.; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2007 | Metabolic modelling of stringent response in recombinant Escherichia coli | Carneiro, S.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 17-Mai-2015 | Metabolic models reconstruction using genome scale information (merlin): assessment and validation | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Metabolic network reconstruction of the central carbon metabolism of Enterococcus faecalis | Portela, Carla; Villas-Bôas, S. G.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 3-Nov-2009 | Metabolic network reconstruction of the pathogen Enterococcus faecalis | Portela, Carla Andreia Freixo; Carneiro, S.; Villas-Bôas, S. G., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 30-Nov-2010 | Metabolic network reconstruction of the pathogen Enterococcus faecalis | Portela, Carla; Villas-Bôas, S. G.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 14-Set-2014 | Metabolic profiling of secreted fermentative byproducts by Salmonella typhimurium | Silva, A.; Sargo, Cintia Regina; Zangirolami, Teresa Cristina, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 3-Nov-2009 | Metabolic reconstruction of less characterized microorganisms : a new methodology for reaction identification from genome sequencing data | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2013 | Metabolic responses to recombinant bioprocesses in Escherichia coli | Carneiro, S.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Artigo | Acesso aberto |
