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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 9-Mai-2019 | Staphylococci phages display vast genomic diversity and evolutionary relationships | Oliveira, Hugo; Sampaio, Marta; Melo, Luís Daniel Rodrigues, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 6-Mai-2021 | Stoichiometric genome-scale models for the chondroitin production in Escherichia coli | Couto, Márcia Regina; Dias, Oscar; Rodrigues, Joana Lúcia Lima Correia, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2022 | Systematic assessment of template-based genome-scale metabolic models created with the BiGG Integration Tool | Oliveira, Alexandre Rafael Machado; Cunha, Emanuel; Cruz, Fernando João Pereira, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 25-Mai-2015 | Systems biology in fungi | Dias, Oscar; Rocha, Isabel | Capítulo de livro | Acesso restrito UMinho |
| 2023 | Systems biology's role in leveraging microalgal biomass potential: Current status and future perspectives | Cunha, Emanuel; Sousa, Vítor; Geada, Pedro, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 17-Jun-2020 | A tailspike with exopolysaccharide depolymerase activity from a new Providencia stuartii phage makes multidrug-resistant bacteria susceptible to serum-mediated killing | Oliveira, Hugo Alexandre Mendes; Pinto, Graça; Mendes, B., et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 10-Mar-2021 | The first multi-tissue diel cycle genome-scale metabolic model of a woody plant highlights the role of the secondary metabolism pathways in Quercus suber | Cunha, Emanuel; Silva, Miguel; Chaves, Inês, et al. | Preprint | Acesso aberto |
| Set-2023 | The first multi-tissue genome-scale metabolic model of a woody plant highlights suberin biosynthesis pathways in Quercus suber | Cunha, Emanuel Rodrigues; Silva, Miguel; Chaves, Inês, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 21-Fev-2019 | The metabolic model of the Quercus suber (cork oak tree) leaf | Demirci, H.; Dias, Oscar; Chaves, Inês, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2013 | Towards a genome-scale metabolic model for the Kluyveromyces lactis yeast | Dias, Oscar; Gombert, Andreas Karoly; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 16-Set-2015 | Towards a genome-scale metabolic model of the Streptococcus pneumoniae R6 avirulent strain | Dias, Oscar; Saraiva, João; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 14-Out-2018 | Towards a genome-wide transport systems encoding genes tracker | Lagoa, D.; Liu, Filipe; Ferreira, Eugénio C., et al. | Poster em conferência | Acesso aberto |
| 2022 | Towards a multivariate analysis of genome-scale metabolic models derived from the BiGG models database | Oliveira, Alexandre Rafael Machado; Cunha, Emanuel Rodrigues; Cruz, Fernando João Pereira da, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 11-Jul-2016 | Towards an improved version of Kluyveromyces lactis genome-scale metabolic model | Dias, Oscar; Santos, Sophia Torres; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Towards genome-wide semi-automated transporter system annotations | Dias, Oscar; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 24-Jul-2017 | Towards the identification of pathways for lipids biosynthesis in HCB | Dias, Oscar; Castro, Rita; Pereira, M. A., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 5-Dez-2019 | Towards the integration of regulatory networks with metabolic models | Bastos, J.; Drescher, P.; Lagoa, D., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2020 | Towards the reconstruction of integrated genome-scale models of metabolism and gene expression | Cruz, Fernando; Lima, Diogo; Faria, José P., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Towards the reconstruction of the genome-scale metabolic model of Lactobacillus acidophilus La-14 | Cunha, Emanuel; Zeidan, Ahmad; Dias, Oscar | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Ago-2023 | TranSyT, an innovative framework for identifying transport systems | Cunha, Emanuel Rodrigues; Lagoa, Davide Rafael Santos; Faria, José P., et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
