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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 2017 | Prediction of overall survival for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer: development of a prognostic model through a crowdsourced challenge with open clinical trial data | Guinney, Justin; Wang, Tao; Laajala, Teemu D., et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2014 | Prediction of protein subunits using KEGG BRITE | Dias, Oscar; Liu, Filipe; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 1999 | Preventing premature convergence to local optima in genetic algorithms via random offspring generation | Rocha, Miguel; Neves, José | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 19-Fev-2020 | ProPythia, an automated platform for the classification of peptides/proteins using machine learning | Sequeira, Ana Marta Fernandes Tavares; Pereira, S.; Lousa, Diana, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Propythia: a Python automated platform for the classification of proteins using machine learning | Sequeira, Ana; Lousa, Diana; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| Mai-2022 | ProPythia: a python package for protein classification based on machine and deep learning | Sequeira, Ana; Lousa, Diana; Rocha, Miguel | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| Jul-2006 | Qos constrained internet routing with evolutionary algorithms | Rocha, Miguel; Sousa, Pedro; Rio, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Quality of service constrained routing optimization using evolutionary computation | Rocha, Miguel; Sousa, Pedro; Cortez, Paulo, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 20-Set-2021 | R2L: routing with reinforcement learning | Reis, João; Phan, Truong Khoa; Kheirkhah, Morteza, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 2013 | Re-annotation of the genome sequence of Helicobacter pylori 26695 | Resende, Tiago; Correia, Daniela M.; Rocha, Miguel, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2002 | Real-Time Forecasting by Bio-Inspired Models | Cortez, Paulo; Rocha, Miguel; Allegro, Fernando Sollari, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 17-Mai-2023 | Recent advances in data- and knowledge-driven approaches to explore primary microbial metabolism | Bartmanski, Bartosz Jan; Rocha, Miguel; Zimmermann-Kogadeeva, Maria | Artigo | Acesso aberto |
| 2021 | Reconciliation of regulatory data: the regulatory networks of Escherichia coli and Bacillus subtilis | Lima, Diogo; Cruz, Fernando; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 8-Jun-2015 | Reconciling gene expression data with regulatory network models | Faria, José P.; Overbeek, Ross; Taylor, Ronald C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 8-Abr-2014 | Reconciling gene expression data with regulatory network models – a stimulon-based approach for integrated metabolic and regulatory modeling of Bacillus subtilis | Faria, José P.; Overbeek, Ross; Taylor, Ronald C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2015 | Reconstructing genome-scale metabolic models with merlin | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 7-Jan-2018 | Reconstructing high-quality large-scale metabolic models with merlin | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Capítulo de livro | Acesso restrito UMinho |
| 2015 | Reconstructing transcriptional regulatory networks using data integration and text mining | Pereira, Rafael T.; Costa, Hugo; Carneiro, S., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Jun-2016 | Reconstruction of metabolic models for liver cancer cells | Ferreira, Jorge; Correia, Sara Alexandra Gomes; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 18-Set-2015 | Reconstruction of regulatory network models and reconciliation with gene expression data | Faria, J. P.; Overbeek, Ross; Taylor, Ronald C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
