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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 2012 | Optimization approaches for the in silico discovery of optimal targets for gene over/underexpression | Gonçalves, Emanuel; Pereira, Rui; Rocha, I., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Abr-2007 | Optimization of bacterial strains with variable-sized evolutionary algorithms | Rocha, Miguel; Pinto, José P.; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2014 | Optimization of fed-batch fermentation processes with bio-inspired algorithms | Rocha, Miguel; Mendes, Rui; Rocha, Orlando, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2016 | Optimizing load balancing routing mechanisms with evolutionary computation | Pereira, Vítor Manuel Sá; Rocha, Miguel; Sousa, Pedro | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Optimizing NFV deployment in segment routing | Camaz, Gonçalo; Pereira, Vitor; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 2017 | Optimizing segment routing using evolutionary computation | Pereira, Vítor; Rocha, Miguel; Sousa, Pedro | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Jul-2017 | OptimModels: a framework for strain optimization using kinetic models | Correia, Sara; Lima, Ana Patrícia Ferreira; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mai-2013 | Parallel evolutionary computation in bioinformatics applications | Pinho, Jorge; Sobral, João Luís Ferreira; Rocha, Miguel | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2002 | Particle Swarms for Feedforward Neural Network Training | Mendes, Rui; Cortez, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| Jun-2022 | A pipeline for the reconstruction and evaluation of context-specific human metabolic models at a large-scale | Vieira, José Vítor Castro; Ferreira, Jorge; Rocha, Miguel | Artigo | Acesso aberto |
| 22-Jul-2021 | A pipeline for the reconstruction and evaluation of context-specific human metabolic models at a large-scale | Vieira, José Vítor Castro; Ferreira, Jorge; Rocha, Miguel | Preprint | Acesso aberto |
| 2020 | Predicting promoters in phage genomes using machine learning models | Sampaio, Marta; Rocha, Miguel; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 15-Dez-2019 | Predicting promoters in phage genomes using PhagePromoter | Sampaio, Marta; Rocha, Miguel; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes, et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 18-Jul-2022 | Predicting the number of biochemical transformations needed to synthesize a compound | Correia, João; Carreira, Rafael; Pereira, Vítor, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 18-Dez-2015 | Prediction of drug targets in human pathogens | Silvério, Rita; Rocha, Miguel; Simões, Carlos J. V., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2017 | Prediction of overall survival for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer: development of a prognostic model through a crowdsourced challenge with open clinical trial data | Guinney, Justin; Wang, Tao; Laajala, Teemu D., et al. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2014 | Prediction of protein subunits using KEGG BRITE | Dias, Oscar; Liu, Filipe; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 1999 | Preventing premature convergence to local optima in genetic algorithms via random offspring generation | Rocha, Miguel; Neves, José | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 19-Fev-2020 | ProPythia, an automated platform for the classification of peptides/proteins using machine learning | Sequeira, Ana Marta Fernandes Tavares; Pereira, S.; Lousa, Diana, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Propythia: a Python automated platform for the classification of proteins using machine learning | Sequeira, Ana; Lousa, Diana; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
