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https://hdl.handle.net/1822/23593
Título: | Compilação de uma biblioteca de referência de DNA barcodes de macroalgas vermelhas e castanhas reportadas para Portugal e análise dos seus perfis fitoquímicos |
Autor(es): | Oliveira, Artur Miguel Lobo |
Orientador(es): | Costa, Filipe O. |
Palavras-chave: | Macroalgas Heterokontophyta Rhodophyta Portugal DNA barcoding COI-5P Perfil fitoquímico Ácidos gordos Macroalgae Phytochemical profile Fatty acids |
Data: | 2012 |
Resumo(s): | Este estudo teve como objectivo contribuir para a compilação de uma biblioteca de referência
de DNA barcodes de macroalgas marinhas Portuguesas com vista à avaliação de perfis
fitoquímicos em espécies rigorosamente identificadas e sua utilização em potenciais aplicações
biotecnológicas e farmacológicas. A biblioteca de referência aqui produzida é composta por
sequências parciais do gene mitocondrial do citocromo c oxidase I (COI), obtidas por
amplificação e sequenciação de espécimes de macroalgas castanhas e vermelhas colectadas
no âmbito deste estudo, aliada à compilação a partir de bases de dados públicas de sequências
homólogas de espécies reportadas para Portugal. Efectuaram-se também análises dos perfis
fitoquímicos de 16 espécies com recurso a High-Performance Liquid Chromatography e Gas
Chromatography. Foi compilada uma biblioteca de referência composta por 241 DNA barcodes
de 100 espécies, 71 das quais pertencentes ao filo Rhodophyta e 29 ao filo Heterokontophyta.
A análise dos DNA barcodes de COI permitiu a distinção clara de espécies em praticamente
todos os casos, salvo raras excepções cujas razões para a sua ocorrência se encontram
devidamente documentadas. As taxas médias de divergência intraespecífica e interespecífica
congenérica observadas no filo Rhodophyta foram 0,21% e 13,94%, respectivamente, e as
mesmas taxas no filo Heterokontophyta foram de 0,22% e 6,94%, respectivamente. Estes
padrões de variabilidade são muito próximos das reportadas em estudos de macroalgas de
ambos os filos, confirmando a validade desta biblioteca de referência. A análise de perfis
fenólicos por meio de HPLC não foi possível devido à concentração reduzida dos extractos
analisados. A análise de perfis lipídicos por meio de GC permitiu confirmar uma maior
variedade de ácidos gordos nas algas castanhas do que nas vermelhas. Os ácidos gordos
maioritariamente presentes nas espécies de Rhodophyta foram C14, C16, C16:1, C18 e
C18:1n9c/t e nas espécies de Heterokontophyta foram C14, C16, C16:1, C18, C18:1n9c/t,
C18:3n3, C18:2n6c e C20:3n3. A combinação de uma biblioteca de referência de DNA barcodes
com maior representatividade de espécies de macroalgas portuguesas, com um estudo mais
aprofundado de perfis fitoquímicos de populações diversas da mesma espécie e/ou género irá
facilitar o acesso a um recurso biológico da costa Portuguesa com grande potencial de
exploração para fins biotecnológicos e farmacológicos. The objective of this study was to assemble a reference library of DNA barcodes for Portuguese red and brown macroalgae in order to evaluate phytochemical profiles in thoroughly identified species and use them for potential biotechnological and pharmacological purposes. The reference library produced in this study is formed by partial sequences from the cytochrome oxidase I (COI) mitochondrial gene, obtained by amplification and sequencing of brown and red macroalgae specimen’s collected in the scope of this study, allied to the assembling of homologous sequence’s from public databases belonging to species reported from Portugal. Phytochemical analyses were also made on 16 macroalgae species using High- Performance Liquid Chromatography and Gas Chromatography. A reference library with 241 DNA barcodes from 94 species was assembled, of which 71 species belong to Rhodophyta and 23 species belong to Heterokontophyta. Analyses of COI DNA barcodes allowed to discriminate different species in almost every case, apart from a few exceptions which are duly interpreted in this study. Average intraspecific and interspecific congeneric divergences were 0,21% and 13,94% in Rhodophyta, respectively, and 0,22% and 6,94% in Heterokontophyta, respectively. These variability patterns are very similar to those reported in other Rhodophyta and Heterokontophyta macroalgae studies, confirming this reference library’s validity. Phenolic analyses with HPLC were not possible due to the extract’s low concentration. Lipid analyses with GC confirmed a larger fatty acid’s variety within brown macroalgae. The major fatty acids present in Rhodophyta species were C14, C16, C16:1, C18 and C18:1n9c/t and in Heterokontophyta species were C14, C16, C16:1, C18, C18:1n9c/t, C18:3n3, C18:2n6c and C20:3n3. Combining a more comprehensive reference library of DNA barcodes for Portuguese macroalgae, with a deeper study on phytochemical profiles from diversified populations of the same species and/or genera will greatly facilitate the access to a biological resource from the Portuguese coast that owns a great potential for biotechnological and pharmacological purposes. |
Tipo: | Dissertação de mestrado |
Descrição: | Dissertação de mestrado em Biotecnologia e Bioempreendedorismo em Plantas Aromáticas e Medicinais |
URI: | https://hdl.handle.net/1822/23593 |
Acesso: | Acesso aberto |
Aparece nas coleções: | BUM - Dissertações de Mestrado DBio - Dissertações de Mestrado/Master Theses |
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