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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 2006 | A comparison of algorithms for the optimization of fermentation processes | Mendes, Rui; Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mar-2012 | Comparison of H. pylori in silico metabolic model predictions with experimental data | Correia, Daniela M.; Cunha, M. L. R.; Azevedo, N. F., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Ago-2009 | Comparison of H. pylori in silico metabolic model predictions with experimental data | Correia, Daniela M.; Cunha, M. L. R.; Azevedo, N. F., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 20-Jun-2019 | Comparison of pathway analysis and constraint-based methods for cell factory design | Vieira, Vítor; Maia, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Jun-2016 | A computation tool for the estimation of biomass composition from genomic and transcriptomic information | Santos, Sophia Torres; Rocha, Isabel | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| Mar-2011 | A computational tool for the simulation and optimization of microbial strains accounting integrated metabolic/ regulatory information | Vilaça, Paulo; Rocha, I.; Rocha, Miguel | Artigo | Acesso aberto |
| 2010 | Computational tools for data integration and regulatory network inference in systems biology | Pinto, José P.; Rocha, I.; Rocha, Miguel | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2012 | Computational tools for strain optimization by tuning the optimal level of gene expression | Gonçalves, Emanuel; Rocha, I.; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 18-Nov-2019 | Computer-aided growth medium design for optimal growth of Chinese hamster ovary cells | Hamdi, Anis; Rocha, I.; Zanghellini, Juergen | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 24-Nov-2016 | Computing and applying atomic regulons to understand gene expression and regulation | Faria, J.; Davis, James J.; Edirisinghe, Janaka N., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 30-Nov-2007 | Constraint-based approach for in silico Escherichia coli combined regulatory/metabolic modelling | Carneiro, S.; Maia, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mai-2011 | Critical perspective on the consequences of the limited availability of kinetic data in metabolic dynamic modeling | Costa, Rafael S.; Machado, C. D.; Rocha, I., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2009 | A critical review on modelling formalisms and simulation tools in computational biosystems | Machado, C. D.; Costa, Rafael S.; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Out-2010 | Cross-cutting computational strategies to genome-scale modelling | Lourenço, Anália; Carneiro, S.; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2013 | Cultivo de Saccharomyces cerevisiae adaptada em D-xilulose sob condições aeróbias e anaeróbias | Suarez, C. A. G.; Cavalcanti-Montano, I. D.; Horta, Ana C. L., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Out-2016 | Current state and challenges for dynamic metabolic modeling | Vasilakou, Eleni; Machado, Daniel; Theorell, Axel, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2009 | Data integration issues in the reconstruction of the genome-scale metabolic model of Zymomonas mobillis | Pinto, José P.; Dias, Oscar; Lourenço, Anália, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2008 | Design and application of genome-scale reconstructed metabolic models | Rocha, I.; Förster, Jochen; Nielsen, Jens | Capítulo de livro | Acesso restrito UMinho |
| Mar-2012 | Design of a biosynthetic pathway for curcumin production in Escherichia coli | Machado, C. D.; Rodrigues, L. R.; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 8-Fev-2006 | Design of estimators for specific growth rate control in a fed-batch E. coli fermentation | Rocha, I.; Veloso, Ana C. A.; Ferreira, Eugénio C. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
