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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 26-Fev-2011 | Selection of thermodynamically feasible and active pathways | Soons, Zita; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 24-Ago-2012 | Selective enrichment of hydrocarbonoclastic bacteria producing storage compounds of biotechnological relevance | Carvalho, A. R.; Castro, Paulo; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Semantic annotation of biological concepts interplaying microbial cellular responses | Carreira, Rafael; Carneiro, S.; Pereira, Rui C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2010 | A software tool for network topology analysis under a Metabolic Engineering perspective | Pinto, José P.; Rocha, I.; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2009 | A software tool for the simulation and optimization of dynamic metabolic models | Evangelista, Pedro; Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2006 | Specific growth rate regulation in a simulated fed-batch E. coli fermentation | Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2014 | Standardization and comparison of the biomass objective functions of manually curated genome-scale metabolic models | Xavier, Joana Rute Calça; Patil, Kiran Raosaheb; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 5-Out-2012 | State and specific growth estimation in heterologous protein production by Pichia pastoris | Barrigón, J. M.; Ramon, R.; Rocha, I., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Out-2016 | Stoichiometric representation of geneproteinreaction associations leverages constraint-based analysis from reaction to gene-level phenotype prediction | Machado, Daniel; Herrgård, Markus J.; Rocha, Isabel | Artigo | Acesso aberto |
| 2011 | Stringent response of escherichia coli: revisiting the bibliome using literature mining | Carneiro, S.; Lourenço, Anália; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2011 | A study of the short and long-term regulation of E. coli metabolic pathways | Lourenço, Anália; Carneiro, S.; Pinto, José P., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 3-Nov-2009 | A study on the effects of using gene-reaction rules on in silico strain optimization | Vilaça, Paulo; Maia, Paulo; Evangelista, Pedro, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2012 | Super model of the world: Enterococcus faecalis | Portela, Carla Andreia Freixo; Villas-Bôas, S. G.; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2012 | Synbiobacther: engineering “therapeutic” bacteria | Rodrigues, L. R.; Rodrigues, Joana Lúcia Lima Correia; Machado, C. D., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 6-Jul-2013 | A synthetic biology approach to engineer "therapeutic" bacteria | Duarte, S. O. D.; Paulo, J.; Machado, C. D., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 11-Out-2010 | System analysis of metabolism in Helicobacter pylori | Correia, Daniela M.; Azevedo, N. F.; Vieira, M. J., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | A systematic modeling approach to elucidate the triggering of the stringent response in recombinant E. coli systems | Carneiro, S.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 31-Jul-2005 | A systems biology approach for the characterization of metabolic bottlenecks in recombinant protein production processes | Carneiro, S.; Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 12-Mar-2005 | A systems biology approach for the optimization of recombinant protein production in E. coli | Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2013 | Systems biology for the development of microbial cell factories | Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
